что такое invitro и invivo
In vivo (лат. — буквально «в (на) живом»), то есть «внутри живого организма» или «внутри клетки». В науке in vivo обозначает проведение экспериментов на (или внутри) живой ткани при живом организме. Такое использование термина исключает использование части живого организма (так, как это делается при тестах in vitro) или использование мёртвого организма. Тестирование на животных и клинические испытания являются формами исследования in vivo.
Ex vivo (лат. из жизни), означает «то, что происходит вне организма», то есть проведение экспериментов в живой ткани, перенесённой из организма в искусственную внешнюю среду. Наиболее распространённая техника ex vivo использует живые клетки или ткани, извлечённые из живого организма и выращенные (сохранённые) в стерильных лабораторных условиях в течение нескольких дней или недель. Такие клетки служат образцами поведения организма в целом, как следствие — сокращается потребность в экспериментах над животными и человеком. Эксперименты ex vivo, как правило, проводятся in vitro, однако два эти термина не являются синонимами.
In vitro (лат. «в стекле») — это технология выполнения экспериментов, когда опыты проводятся «в пробирке» — вне живого организма. В общем смысле этот термин противопоставляется термину in vivo — эксперимент на живом организме (на человеке или на животной модели). Многие эксперименты, имеющие отношение к молекулярной биологии, биохимии, фармакологии, медицине, генетике и др., проводятся вне организма, на культуре живых клеток или в бесклеточной модели.
Эксперименты in vitro, в тех случаях, когда альтернативой являются исследования на животных или человеке, считаются менее достоверными, чем in vivo и часто бывают лишь необходимой предварительной стадией для оценки возможности и необходимости последующих исследований in vivo. Однако они часто удешевляют предварительные стадии исследования и позволяют сохранить жизнь подопытных животных.
In silico — термин, обозначающий компьютерное моделирование (симуляцию) эксперимента, чаще биологического. Фраза была создана по аналогии с фразами in vivo (в живом организме) и in vitro (в пробирке), которые часто используются в биологии, и сама не является латинской.
Пытаемся разобраться в медицинских исследованиях: в чем разница между in vivo и in vitro
В эпоху информационного шума и огромного количества тревожных новостейж всегла лучше обращаться к первоисточнику. Начнем с азов: эти два термина звучат очень похоже, их часто путают. Но смысловое значение существенно различается (это на самом деле важно знать).
Исследования в науке и медицине
Для того, чтобы запустить в массовое производство различные препараты – косметические, лекарственные или БАДы, они должны пройти ряд испытаний, которые подтвердят эффективность и безопасность этих средств. Тогда и проводится серия экспериментов с приставкой in vitro и in vivo. Слова во многом похожи, однако между ними есть очень большая разница. Они обозначают совершенно разные виды испытаний. Разберемся с этими понятиями на примере косметических средств и испытаний лекарств, вакцин.
Исследования in vitro и in vivo, а также некоторые другие, проводятся в отношении эффективности косметических продуктов для жирной или сухой кожи, увлажнения, старения кожи, пигментации, роста волос и т. д. Также они изучают безопасность и эффективность определенных лекарств или добавок.
В чем разница между методами тестирования in vitro и in vivo
Эти эксперименты обычно проводятся в рамках клинических исследований, испытаний новых препаратов, косметических компонентов, биодобавок и различных возбудителей инфекций (вирусы, грибки или бактерии), вакцин или сывороток против них. Научные эксперименты «в пробирках» и на живых объектах необходимы для расширения объема знаний о различных заболеваниях, методах их лечения, работе организма, влиянии на него тех или иных составов. Также эти виды экспериментов применяются для новых научных открытий, проверки теоретических гипотез на практике. Использовать могут как один из методов, так и оба сразу.
Что такое методы тестирования in vitro и ex vivo
Сегодня косметическим брендам доступно множество методов тестирования, которые хотят проверить свои продукты на безопасность, охарактеризовать их эффективность и активные ингредиенты, начать исследования и разработку новых рецептур.
In vitro включает эксперименты с биологическим веществом (клетками или тканями) вне живого организма. Эксперименты in vitro действительно проводятся в стекле – на чашке Петри или внутри пробирки, хотя сегодня им на смену приходят и современные пробирки из пластика или иных материалов.
Одна из особенностей тестирования in vitro заключается в том, что определенная линия клеток (например, кератиноциты, фибробласты или меланоциты – все это клетки кожи) выделяется, отделяется и очищается от их обычного биологического окружения. Это позволяет проводить более подробный клеточный и молекулярный анализ и оценку реакций клеток по сравнению с использованием в рамках всего организма. Кроме того, изолированные клетки, как правило, при правильных условиях можно подращивать и делить, чтобы получить запас и партии для будущего повторного использования.
Эксперименты in vitro можно проводить на широком круге подопытных объектов, от бактерий и вирусов до клеток, полученных из живых организмов. Благодаря современной науке, сейчас доступны все более сложные модели in vitro.
Тестирование косметики и лекарств in vitro и ex vivo
Исследования in vivo
Сходство in vivo и in vitro
Прежде всего, есть одно существенное сходство между in vivo и in vitro: это их цель. Как и во всех медицинских исследованиях, независимо от того, проводятся ли они in vitro или in vivo, цель всегда одна: лучше понять определенное заболевание и способы его лечения, а также расширить знания о различных функциях тела. Тем не менее, в этих исследованиях есть много различий, и зачастую эксперименты в лаборатории проводятся первыми, для того, чтобы убедиться в безопасности методики. Только после этого уже переходят к исследованиям на животных, а потом – на людях-добровольцах.
In vitro и In vivo: в чем разница
В медицинских статьях, описывающих те или иные исследования, часто употребляются два похожих термина – «in vitro» и «in vivo». Разберемся подробнее, что же они означают.
Термин «in vitro» переводится как « в стекле» и означает, что эксперименты проводятся вне живого организма. Термин «in vivo» в переводе звучит как «в жизни», соответственно, эксперимент проходит в естественных условиях. В целом же обе эти методики помогают ученым больше узнать о болезнях и разнообразных процессах, происходящих в живом организме.
In vitro
Итак, тестирование «in vitro» чаще всего происходит в условиях лаборатории и подразумевает изучение микроорганизмов, клеток животных или человека в определенной культуре. Эта методика помогает оценивать процессы, происходящие в конкретных клетках без целого ряда отвлекающих факторов, присущих живому организму.
Это довольно простая методика, и она позволяет изучать больше субъектов, чем при экспериментах с участием людей и животных. Но самый главный недостаток таких исследований, что среда в чашке петри не может быть полностью схожа со средой живого организма.
Довольно часто тестирование «in vitro» применяют в ходе фармацевтических испытаний. Новые лекарства всегда проверяются таким образом перед началом клинических испытаний с участием добровольцев.
Кроме того, метод «in vitro» лежит в основе наиболее эффективного метода лечения бесплодия – ЭКО. При экстракорпоральном оплодотворении процесс соединения двух клеток проходит не внутри организма, а в специальной среде. И только потом получившийся эмбрион подсаживают в матку женщины.
In vivo
Исследования «in vivo» также популярны в фармакологической промышленности. В целом такие тесты – крайне важный аспект медицинских исследований. Главными тестами «in vivo» являются тесты на животных и клинические испытания.
В ходе экспериментов с участием животных ученые имеют возможность выявлять процессы, лежащие в основе разных болезней и патологий. Можно сказать, что такие тесты – промежуточный этап между тестированием «in vitro» и испытаниями на людях.
Клинические испытания на людях – чаще всего завершающий этап любого крупного исследования. Обычно они применяются в фармакологии при выводе на рынок нового препарата или вакцины.
In Vivo против In Vitro: что все это значит?
Возможно, вы встречали термины «in vitro» и «in vivo», читая о научных исследованиях. Или, возможно, вы знакомы с ними, потому что слышали о таких процедурах, как экстракорпорально
Содержание:
Возможно, вы встречали термины «in vitro» и «in vivo», читая о научных исследованиях. Или, возможно, вы знакомы с ними, потому что слышали о таких процедурах, как экстракорпоральное оплодотворение.
Но что на самом деле означают эти термины? Продолжайте читать, поскольку мы разберем различия между этими терминами, приведем несколько примеров из реальной жизни и обсудим их плюсы и минусы.
Определения
Ниже мы рассмотрим некоторые определения более подробно и обсудим, что означает каждый термин в различных контекстах.
В естественных условиях
In vivo в переводе с латыни означает «в живых». Это относится к работе, выполняемой целым живым организмом.
В пробирке
In vitro с латыни означает «внутри стакана». Когда что-то выполняется in vitro, это происходит вне живого организма.
На месте
In situ означает «на исходном месте». Он находится где-то между in vivo и in vitro. То, что выполняется на месте, означает, что это наблюдается в естественном контексте, но вне живого организма.
Примеры из реальной жизни
Теперь, когда мы определили эти термины, давайте рассмотрим их примеры из реальной жизни.
Исследования
В научных исследованиях используются методы in vitro, in vivo или in situ. В некоторых случаях исследователи могут использовать несколько методов для проверки своей гипотезы.
В пробирке
Методы in vitro, используемые в лаборатории, часто могут включать такие вещи, как изучение бактериальных, животных или человеческих клеток в культуре. Хотя это может обеспечить контролируемую среду для эксперимента, это происходит за пределами живого организма, и результаты необходимо тщательно анализировать.
В естественных условиях
Когда исследование проводится in vivo, оно может включать в себя такие вещи, как проведение экспериментов на модели животных или клинические испытания на людях. В этом случае работа происходит внутри живого организма.
На месте
Методы in situ можно использовать для наблюдения за объектами в их естественном контексте, но за пределами живого организма. Хорошим примером этого является метод, называемый гибридизацией in situ (ISH).
ISH можно использовать для поиска определенной нуклеиновой кислоты (ДНК или РНК) в чем-то вроде образца ткани. Специализированные зонды используются для связывания с определенной последовательностью нуклеиновой кислоты, которую пытается найти исследователь.
Эти зонды помечены такими вещами, как радиоактивность или флуоресценция. Это позволяет исследователю увидеть, где находится нуклеиновая кислота в образце ткани.
ISH позволяет исследователю наблюдать, где находится нуклеиновая кислота в ее естественном контексте, но за пределами живого организма.
опыление
Вы наверняка слышали об экстракорпоральном оплодотворении (ЭКО). Но что именно это означает?
Поскольку оплодотворение происходит в лабораторных условиях, а не в организме (in vivo), процедура называется оплодотворением in vitro.
Чувствительность к антибиотикам
Существует много типов или классов антибиотиков, и некоторые бактерии более чувствительны к одним классам, чем к другим. Кроме того, бактерии могут развиться и стать устойчивыми к антибиотикам.
Хотя бактериальные инфекции возникают на нашем теле или внутри него, тестирование на чувствительность к антибиотикам часто проводится в лабораторных условиях (in vitro).
Факторы, которые следует учитывать
Теперь, когда мы рассмотрели определения и изучили несколько примеров, вам может быть интересно, есть ли преимущества или недостатки в использовании одного над другим.
При сравнении работы in vitro и in vivo необходимо учитывать несколько факторов. Они могут включать:
контекст
Наши тела и системы, которые их составляют, очень сложны. Из-за этого исследования, проведенные in vitro, могут не точно воспроизводить состояния, возникающие в организме. Следовательно, результаты следует интерпретировать осторожно.
Примером этого является оплодотворение in vitro по сравнению с оплодотворением in vivo.
In vivo очень немногие сперматозоиды могут потенциально оплодотворить яйцеклетку. Фактически, отбор конкретных популяций сперматозоидов происходит в маточной трубе.Во время ЭКО можно лишь частично имитировать отбор спермы.
Однако динамика отбора в фаллопиевых трубах, а также качества популяций сперматозоидов, отобранных in vivo, являются областью повышенного изучения. Исследователи надеются, что результаты будут лучше информированы при выборе спермы для ЭКО.
корреляция
В некоторых случаях то, что вы наблюдаете in vitro, может не коррелировать с тем, что на самом деле происходит in vivo. Давайте возьмем в качестве примера тест на чувствительность к антибиотикам.
Как мы обсуждали ранее, тестирование чувствительности к антибиотикам можно проводить с использованием нескольких методов in vitro. Но как эти методы соотносятся с тем, что на самом деле происходит in vivo?
Одна статья посвящена этому вопросу. Исследователи обнаружили некоторые несоответствия между результатами тестирования in vitro и фактическими клиническими результатами.
Фактически, 64 процента людей, инфицированных бактериями, которые, как сообщалось, были устойчивы к антибиотику цефотаксиму, имели положительный ответ на лечение антибиотиком.
изменения
В некоторых случаях организм может адаптироваться к среде in vitro. Это, в свою очередь, может повлиять на результаты или наблюдения. Примером этого является изменение вируса гриппа в ответ на лабораторные субстраты для выращивания.
Было замечено, что клинические изоляты вируса могут образовывать частицы, имеющие длинную и нитевидную природу. Продолжающийся рост яиц иногда, но не всегда, может изменить форму вируса с нитчатой на сферическую.
In vivo относится к случаям, когда исследования или работа проводятся с целым живым организмом или внутри него. Примеры могут включать исследования на животных моделях или клинические испытания на людях.
In vitro используется для описания работы, выполняемой вне живого организма. Это может включать изучение клеток в культуре или методы проверки чувствительности бактерий к антибиотикам.
In vivo — in vitro — in silico
In vivo — in vitro — in silico
Кремний (Si), химический элемент IV группы периодической системы Менделеева; атомный номер 14, атомная масса 28,086. Кремний — полупроводник, нашедший широкое применение в электронике для изготовления элементов полупроводниковых схем (от простейших транзисторов до сверхбыстрых современных процессоров).
Автор
Редакторы
Статья является введением к теме «Сухая биология» — в ней раскрывается смысл понятия in silico, а так же обсуждается его взаимосвязь с такими устоявшимися терминами как in vivo и in vitro.
Открывая этот новый раздел, хочется сказать несколько вводных слов, так как у большинства читателей наверняка может возникнуть вопрос: «что такое „in silico“?».
За последние несколько десятилетий развитие компьютерной техники достигло небывалых размахов. И как следствие компьютеризация захватила многие отрасли науки и техники. Биология также не является исключением. Если раньше компьютер рассматривался лишь как средство обработки экспериментальных данных, характер которых мог быть чрезвычайно разнообразным, от статистических исследований численности популяций, до обработки данных рентгеноструктурного анализа, то со временем стала развиваться идея полностью компьютерного эксперимента. Теперь компьютер стал рассматриваться как среда проведения эксперимента, т.е. имея на входе определенные исходные параметры, мы можем получить некие результаты моделирования, описывающие поведение исследуемой нами системы. Для обозначения всего, что связано с компьютерными экспериментами, в 90-е годы XX века даже возник полушутливый латинизм — in silico (от in silicon, т.е. «в кремнии» — подробнее см. 1–2), который дополнил ряд уже имеющихся еще с конца позапрошлого столетия классических определения характера экспериментальной среды — in vivo («вживую» — т.е. непосредственно в биологической системе), in vitro («в стекле», то есть в среде искусственно созданной — в пробирке), см. рис. 1. Термины in vivo и in vitro хорошо прижились среди экспериментаторов, однако смысл их использования достаточно относителен. Так, под in vivo молекулярный биолог, изучающий аспекты синтеза белка, может подразумевать колонию искусственно выращенных клеток, а под in vitro — систему бесклеточного синтеза в пробирке. При этом, для физиолога, изучающего механизмы проведения нервного импульса, in vivo — это целый организм, а in vitro — культура нервной ткани. В свою очередь, подход in silico также многоуровневый и включает в себя задачи по моделированию поведения отдельных молекул, биохимических процессов и даже функционированию отдельных физиологических систем.
Рисунок 1. Многоуровневый подход в изучении биологических систем: in vivo — т.е. в живом объекте (а), in vitro — т.е. в искусственно смоделированной среде (б), in silico — т.е. в полностью смоделированной на компьютере биологической системе (в).
Учитывая тематику нашего сайта, в разделе «Сухая биология» мы будем помещать материалы, в основном посвященные современным методам молекулярного моделирования. Молекулярное моделирование — это один из аспектов понятия in silico, который представляет из себя набор вычислительных методов, позволяющих с разной степенью физичности на атомарном уровне изучать молекулярные системы разной сложности. Методы молекулярного моделирования можно разбить на определенные группы, которые объединяют различные подходы, позволяющие решать задачи разного характера. К первой такой группе можно отнести все методики анализа биологических текстов (аминокислотных и нуклеотидных последовательностей), а также работу с соответствующими базами данных — ныне эта область получила специальное определение — биоинформатика. Следующая группа методов объединяет методики изучения эволюции молекулярных систем с использование эмпирических силовых полей. Набор подходов, позволяющих определять пространственную структуру белковых молекул, учитывая имеющиеся структурные шаблоны белков с гомологичными аминокислотными последовательностями, получил название моделирование на основании гомологии. Наконец, специальные подходы, позволяющие изучать взаимодействия типа лиганд-рецептор или фермент-субстрат, относятся к области молекулярного докинга. Обо всем этом вы узнаете подробнее на страницах раздела «Сухая биология».